跨行转账手续费扣多少与转账的渠道以及转账金额有关。若用户通过柜台、ATM机进行转账，需要支付手续费，跨行转账手续费一般在1-50元不等，具体收费额度由银行的收费标准和个人转账金额来定。若用户用网上银行或手机银行转账，免收手续费。
如果转账金额在2000元以下，建行柜台跨行转账和ATM机跨行转账手续费都是2元/笔，网上银行和手机银行跨行转账不收手续费；
如果转账金额是2000元–5000元，建行柜台跨行转账和ATM机跨行转账手续费都是5元/笔，网上银行和手机银行跨行转账不收手续费；
如果转账金额是5000元-10000元，建行柜台跨行转账和ATM机跨行转账手续费都是10元/笔，网上银行跨行转账手续费是5元/笔，手机银行跨行转账不收手续费；
如果转账金额是10000元-50000元，建行柜台跨行转账和ATM机跨行转账手续费都是15元/笔，网上银行跨行转账手续费是7.5元/笔，手机银行跨行转账不收手续费；
如果转账金额在50000元以上，建行柜台跨行转账手续费按0.03%收取，50元封顶，网上银行跨行转账手续费按0.015%收取，25元封顶，手机银行跨行转账免手续费，不支持网上银行跨行转账。