做市转让是指根据有关规定，在新三板正常转让日内，做市商必须连续报出其做市证券的买价和卖价，若投资者的限价申报满足成交条件，则新三板做市商在其报价数量范围内，有按其报价履行与其成交的义务。也就是说，投资者需要买卖股票时，买卖双方不直接成交，而是通过新三板做市商作为对手方，只要是在报价区间就有成交义务。
无论对于协议转让还是做市转让，投资新三板都可能为投资者带来巨大财富，但也可能让投资者面临巨大风险，这也是新三板市场设置较高的投资者准入门槛的重要原因。
目前，新三板市场投资风险主要类型：挂牌企业运营风险、公司信息披露风险、市场流动性风险、管理制度变迁风险等等。