创业板和新三板的定义不同，创业板属于二级股票市场，新三板为第三股票交易市场；创业板上市条件更严格，另外投资群体也不同。
定义不同：主板、中小板、创业板、新三板都是多层次资本市场的一部分。创业板市场又被称为第二股票交易市场，在创业板市场上市的公司大多是从事高科技业务，具有较高的成长性，成立时间较短，规模较小，业绩也不突出的新兴公司。新三板为第三股票交易市场，主要针对的是中小微型企业，为非上市股份有限公司的股份公开转让、融资、并购等相关业务提供服务，股票代码以43开头。
上市条件不同：创业板上市条件众多，在主题资格、独立性、规范运行、财务会计、募集资金投向等方面都有严格限制。而目前新三板挂牌的法定条件仅6条，且多为定性指标，具体尺度由主办券商判断、把握。
投资者群体不同：除了法律规定禁止买卖股票的人群之外，其他人都可以到证券公司开户买卖创业板股票，对最低资金没有要求。而新三板的投资者则以风险承受能力较强的机构投资者为主，如果是个人投资者，那么其名下的证券类资产市值需要达到500万元以上。