《圣安地列斯》游戏有许多剧情任务，有些很简单，一边看剧情一边就可以把任务完成，而有些任务就比较具有挑战性，玩家常常来不及思索剧情，应付任务就精疲力竭了，总的来说具有难度的剧情任务大概有6个。
第一个是暗度机舱，这个任务的难点在于玩家按正常速度驾驶摩托是开不上飞机的，导致玩家在追飞机的路程无限循环，要完成这个任务也很简单，玩家需要在开摩托车的同时按下飞机起飞键，这样就会按下摩托车车头加速行驶，注意躲避飞机抛下的油罐就能开上飞机。
第二个是逆道追踪，玩家通关这个任务可以选择保持摩托车在火车右侧让小伙伴攻击敌人，或者直接开上火车杀死敌人再下车。
第三个是结局三部曲，这个任务分为三个部分，完成任务的关键在于第二部分冲下楼梯前要先在保安室穿好防弹衣，才能保证安全。
第四个是自由落体，需要玩家精准控制小飞机的爬升，并从上面跳伞进入敌机杀死敌人完成任务。
第五个是飞行学院，其中包含了10个小任务，比较难的一个需要玩家驾驶直升机瞄准地下载具，摧毁处于地下的目标。
第六个也是最难的补给线任务，玩家如果追击不成可以提前设伏，更容易通关。