第一关 欢迎来到黑山研究所
伴随着巨大的爆炸声，我只见眼前一黑，顿时失去了知觉。当我醒来时，我发现自己正身处在一个完全陌生的环境中。在我的面前，一个穿着白大褂的博士模样的人正在那儿抢救我的一个同伴。我走上前，耐心地听完他喋喋不休的E文，便开始了我的危险之旅。
从医务室（infirmary）出来，穿过一条空无一人的走廊，推开走廊的大门向左拐，在最里面的一个大厅里，发现两名医务人员正在那儿观察蜘蛛怪对我同伴的尸体起作用的过程。在角落的方桌上，放着我们来时穿的作战外套。我走过去，毫不犹豫的穿上外套，然后离开大厅，沿着大门对面的走廊通道向前。在另外一间大厅的右侧，一个变异的生物正在发疯地撕咬研究人员的尸体，看见我之后，它从破碎的窗口跳将出来。由于我手无寸铁，我决定三十六计，走为上计。一阵小跑，我来到了大厅的另一端。这儿破烂不堪的大门标着安全出口security clearance)几个字样。我顺着门后的楼梯来到地下室中，找到警卫人员，几句对话之后，他打开了安全门。在他的祝福声中，我走进了一间激光束四射的房间，在其走廊上发现了一把管道钳。小心的绕过电线，拾起管道钳，匍匐通过两道激光束后，我来到了激光反射镜前，用刚到手的管道钳打碎激光反射镜，所有的电源消失。继续沿着楼梯向前走，走廊的天花板突然碎裂，两只蜘蛛怪从天而降，用管道钳解决他们之后，我走到一间毒液横流的小房间前，在几个机械装置的后面遭遇蜘蛛怪的攻击。不过，战斗很快就结束了。在路过一个楼梯口时，我找到了一些补给品。出了过道，我的眼前一亮，原来不知不觉之间，我已经走出了建筑物，到达一个峭壁四立的峡谷之间。
我使出浑身的解数，经过一系列的翻转腾挪，跳到一个断裂的桥面上，在桥面上有一具尸体，其对面就是进入敌人深处的入口。从尸体上得到一把匕首，然后一咬牙，跳到对面的桥面。在一间黑暗的房间内，消灭掉来袭的生物后，打开夜视仪，从房间右下角的一个洞口，来到一个盆地的空地上。举目望去，我们的飞机残骸散落四处，在飞机残骸的外围是弧光肆意的电网。在右面的山崖上有一扇大门，我从大门的门缝中溜了进去，干掉几只蜘蛛怪后，我来到另一处盆地。这里是敌人的动力车间（power generator），厂房的大门紧闭，幸好在大门的左下方有一个通风口。在木箱里找到一些补充物品后，我沿着通风口一路爬行，避过厂房内的高压电火花，到达电网包围的变压器群中。在我方队员的尸体处得到一把手枪。绕过变压器，在对面的墙壁上找到方型的控制盒（Generator Control），（用使用物品的键）拉下电闸，所有的高压电突然消失。然后，我沿着来时的路朝有飞机残骸的盆地跑去。在消灭蜘蛛怪的地道内，我身后突然出现一个闪电怪。不过，我的手枪也不是玩具。解决怪物后，来到飞机残骸前，这里的高压电网已经停止运转。在围墙内找到一些补给和一个电台，打开电台，接受总部传来的下一个任务。然后，从左边水泥平台的通风管道口，一路顺着梯子来到一个寂静的地下建筑中。
这里四处吊着一些绳索样的东西，它们都是长舌怪的触须，小心绕过这些触须，沿着走道，越过一个峡谷，进入一间建筑物内。在走廊的士兵尸体身上可以得到一支步枪。在下梯子的时候，遭遇到几个闪电怪物的袭击，同时那些高温的蒸汽也成了我闪避时的障碍。处理完这些意外的事件后，通过一段迂回曲折的走廊，来到一个向下的楼梯前。两个闪电怪乘电梯而下，小心应付完后，纵身跳进左面的大厅中。进入大厅，我发现自己已经没有任何的退路，仅在大厅的右边有一根通向上层横梁的铁梯。小心的靠近（此处一定要存盘），高压电光突然四处迸发，地板和上层的横梁也纷纷断裂，我瞅准时机，在一段横梁下落的瞬间，爬上铁梯，到达顶端后，迅速向左移动。在一个警报灯乱闪的小门前静静地休息了一阵，待一切平静下来之后，我推开门，走了进去。
经过曲折的回廊，我找到一个升降梯，它的对面是一个废弃的控制室。打开升降梯，来到一间毒液汹涌，电光乱窜的大厅中。我四处搜寻了一些补给品，并抽空消灭了六只蜘蛛怪（在大厅向上的楼梯口，有一个炸药箱，可以加以利用）。楼梯的尽头是一间控制室，在控制台对面的墙壁上有一个标有红十字的装置，在那儿，我获得了50点的生命值。然后从容地走到控制台前，先将大厅中间横梁处天车上的炸药箱引爆，接着按下按纽，扳动闸刀，将天车移动到左边，位置刚好适合我跳到对面的铁箱上。然后从控制室的窗口爬出，利用天车跳到对面的铁箱上，走下铁箱，按住铁门左下角的按纽，这时通道的铁门缓缓升起。接着我深吸一口气，纵身跳到对面的地板上，这时只觉身体一麻，原来被电光击中了，幸好我的护甲和生命值都还比较高。再次到控制台前，将天车调节到视野中央，再通过天车到达对面有蜘蛛怪的小铁箱上。一个空翻，安全地进入通道。
由于没有生物，整个通道显得空旷而寂静。在通道的尽头有两根路障，我伏下身子悄悄地钻了过去，来到一个沉寂的大厅中。在大厅右侧的角落里，找到一处破烂的下水管道，我毫不犹豫的跳了进去。只听耳边水声淙淙，这时我无法控制自己的行动，任凭流水把我带到一间地下水池中。
在水池的屋顶上，四处布满了长舌怪，我小心翼翼地从左边的一个防堵栅栏的缺口处游到隔壁的水池中。找到水池角落里的梯子，顺着梯子向上，谨慎地绕过头顶上的长舌怪，过几段长廊，在一个铁桥对面走廊的桌子上我找到一枚手雷，仔细地收好后，沿着走廊，来到了机器人装运室。在铁桥的左边，一个机器人正在繁忙地工作，为了让它更顺利地执行工作，我引爆了它身边的障碍物。然后静静地目送它离去。当机器人的背影从我眼中消失后，通往下层的梯子前的横杆也随之消失，于是，我顺着桥尽头梯子，下到充满了毒液的操作室中。利用铁箱，走到控制台斜对面的铁门前，打开开关，乘电梯到达顶端，消灭四个肉乎乎的电光怪。然后跑上斜坡，将装有木板的小车推到电车旁，（下蹲+跳键）跳到小车上，接着进入电车，走到电车中央，电车启动并把我带向未知的远方。
第二关 撤 退
我趴在电车中，躲过途中闪电怪的袭击。最后，电车在一个平台边停了下来，我刚走出电车几步，背后出现两个闪电怪，消灭它们之后，我捡起地上的一只手枪和弹药。迈步走进房间，与警卫交谈，他答应帮助我。我们一起向前，共同解决掉路上的怪物，一扇紧闭的房门拦住了我们的道路。透过玻璃窗，我看见屋内警卫正在和研究人员交谈，突然，一只恐龙似的怪兽倏忽而至，杀死了屋内的警卫和研究人员，在它消失的一瞬间，巨大的能量震碎了我面前的玻璃。我乘势从窗户上跳进去，来到门前，等待警卫开门进来打开安全室（Security）的门。随后，我从窗户上进入对面的房间中，在研究人员处得到一些补给。旁边大厅中央停放着一部电梯，杀死旁边的蜘蛛怪，乘坐电梯向上升，快到顶时，向上扔颗手雷，在一片惨叫声中，我收集到一些补给品。加上护甲后，从铁箱上打开通风口钻进去。这段路的终点是在一间士兵宿舍里，在这一片区域里，战利品很多。但当我来到通往外面的大厅时，大门已经缓缓落下。稍等片刻，三个闪电怪出现，消灭它们后，从大厅墙壁的破毁处我进入通风管道。
第三关 迷 失
顺着通道，我来到一个小房间里，杀死看守的闪电怪，从房屋的三层管道处钻进通风管。管道里有两个出口，一个通往补给品房间，离入口较近的出口则通向一段红光掩映的走廊。走廊的地板很容易塌陷，我好不容易才通过这段陷阱重重的长廊，到达两个巨大的风扇前。小心地踩着风扇上的十字横杆走到对面的窗口，狂奔到另外一间有四个风扇的房间里。在下层右边的风扇下，找到出口，安全地下到一个火龙飞舞的房间，一一通过火龙，从左边的通风口爬到另一个有火焰的房间里。利用火焰停顿的间隙，钻进里面的火焰接受孔中，跳出火焰槽，消灭冲过来的变异生物，把标有DANGER EXPLOSIVE字样的炸药箱推到旁边写着WARNING的火焰测试口处，然后到控制台按下按纽。一声巨响过后，地板出现一个大洞。
从洞口下去，干掉几个蜘蛛怪，随后从墙壁的豁口来到一个平台上，平台的下层有一些补给物。跳下平台，进入停着汽车的大门，向左到达2号储藏室，消灭右边拐角处的几只怪物，接着打开左边的铁门，用手雷结束了室内怪物的生命。在台阶的木箱里找到一枚火箭筒。拐过走廊，杀死两只刺龙怪，从墙壁的缺口跳到对面的平台上。沿梯子下到地面，经毁坏的电梯进入一楼。找到有警告牌（CAUTION）的房间，慢慢地走到对面，依次跳到铁箱顶后，进入走廊，在左侧的小室中关闭电源，接着从走廊的另一端跳出，原路回到楼上的缺口对面。沿下垂的绳索攀缘而上，经电梯进入走廊。找到走廊的通风口，把门前的铁箱推到通风口下（注意铁箱和墙壁要留出较大的空间），接着沿管道到达铁门的另一边。打开铁门，将铁箱推到杂物封堵的大门前，凭借铁箱跳过障碍物，用枪引爆旁边屋内的炸药。在将铁箱推倒障碍物后的通风口下。钻进通风管道，进入一个小室内，从地板口下到下层，关闭电源，接着沿电源上方的绳索到达一间凌乱的房间中，打开电台，按动两次，左面的墙壁轰然洞开。与援军对话之后，走到电梯旁，按爆按纽，随后接应人员用切割枪打开房门，我们并肩走进电梯，来到下一关。
第四关 援 军
刚走出电梯，迎面几个闪电怪向我袭来。与战友合力消灭怪物后，队友打开一扇铁门，在里面的铁皮小屋里，我找到一枚感应炸弹。接下来，我一人继续沿楼梯向上，这里的房间和走廊四处是闪电怪的身影。一一消灭完所有的怪物后，我在一个有巨大方桌的房间里停下来，当我刚捡起一个医疗包时，对面的墙里突然跳出一只闪电怪，一结束它的生命，我立刻冲进去消灭掉里面的残余势力。同时，只听右侧一声巨响，原来是大门被炸开了。走进去发现房间的一角也被炸开一个大洞。于是，我从洞口开始我的危险旅程。
小心的绕过沿途的长舌怪，在一个充满电光的断桥