投资者在三板市场上交易个股，与投资者在a股市场上交易个股差不多，在三板市场上输入股票代码、交易价格、交易数量进行买卖即可，只不过三板市场与a股市场相比较，三板市场因交易不够活跃，容易导致投资者的交易单出现部分成交，或者不成交的情况。
三板市场上的个股交易时间为：交易日早上的9：30－11：30，下午的13：00－15：00，其中老三板交易，投资者的每笔委托单必须是1000股，卖出时不足1000股，应一次性卖出，而新三板每笔委托单，最低门槛为100股即可。
同时，老三板市场上的个股，有的股票是一个星期只交易一天，有的股票是一个星期只交易一、三、五，还有的股票是一周五天都交易的，个股涨跌幅为5％。
而新三板交易规则每笔委托的股份数量应不低于3万股，但账户中某一股份余额不足3万股时可一次性报价卖出。