散户投资者如果想交易新三板的股票，首先需要将新三板的权限开通，开通基础层、创新层需要：分别满足前10个交易日日均资产不低于200万、100万的资金要求和2年的投资经验。开通权限后，就可以在交易软件中的“股转系统中”购买。
新三板精选层的股票已于2021年11月15日在北交所上市，如果要交易北交所的股票，则需要将北交所的权限开通，要求如下：个人投资者准入门槛为开通交易权限前20个交易日日均证券资产50万元，同时具备2年以上证券投资经验。
新三板基础层和创新层股票的交易规则如下：
转让时间：9:15-11:30；13:00-15:00。
委托规则：每笔委托数量大于或等于1000股，单笔不足1000股时需一次性卖出。
交割方式：T+1日交割方式。
涨跌幅限制：挂牌首日均不设置涨跌幅限制，次日后创新层实施50%的涨跌幅限制、基础层集合竞价为100%的涨跌幅限制。