本周《自然》和《自然-医学》在线发表了人类微生物组整合计划（iHMP）的三篇论文，概述了宿主和微生物组之间的互作如何影响人体健康。iHMP 调查了在炎症性肠病（IBD）、前驱糖尿病、怀孕和早产中，微生物组和宿主的变化。所得发现有助于表征这些疾病，预测病人转归，将来或许还能促进治疗。
人体微生物组因个体、群体和环境而异，并且已知会影响人类的健康和疾病状态。iHMP 采用多组学方法探索了微生物组和宿主的时间动态变化（如免疫响应和新陈代谢），以便理解这些疾病中的微生物-宿主互作。
美国哈佛大学陈曾熙公共卫生学院的 Curtis Huttenhower 及同事研究了 132 名 IBD 患者和健康的对照组被试。
在第一篇《自然》论文Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases中，作者鉴定出了微生物组组成的变化、肠道内宿主源和微生物组源分子的变化以及基因表达的转变。
作者总结表示，这项研究对 IBD 中的宿主和微生物活动进行了迄今为止最全面的描述，有望为理解疾病发病和进展带来深刻见解。
在 IBDMDB 研究中 IBD 微生物的多组学分析
来源：Price et al.
在第二篇《自然》论文Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes中，美国斯坦福大学医学院的 Michael Snyder 小组报告了前驱糖尿病中宿主和微生物组之间的互作。前驱糖尿病会导致糖尿病，但是经常得不到确诊。
研究小组对 106 名健康个体和前驱糖尿病个体进行了为期 4 年的研究，分析了分子变化、遗传变化和微生物变化。他们发现了可以定义早期疾病发展的规律——在某些情况下，这可能有助于及早检测出 2 型糖尿病。
研究设计摘要及群组细节和数据
来源：Zhou et al.
发表在《自然-医学》上的论文The vaginal microbiome and preterm birth则描述了阴道微生物对于早产风险（全球早产率超过 10%）的影响。美国弗吉尼亚联邦大学的 Gregory Buck 及同事在1,527 名孕妇的整个孕期内对其进行了研究，揭示了与早产（不足 37 周）风险相关的阴道微生物组变化，尤其是对非洲裔妇女而言。
例如，研究发现早产孕妇的卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）水平低于足月妊娠的孕妇，而过去的研究已经表明卷曲乳杆菌与妇女健康有关。他们还在早产孕妇体内发现了大量过度存在的不同种类细菌。这项研究或许有助于未来提前预测早产。
MOMS-PI 研究数据
来源：Fettweis et al.