女高中生一侧的问题更甚。由于电子宠物的女生团体的“共同话题”特征，使得一些学生为了融入群体而被迫去购买电子宠物。而后期电子宠物因为出现了极端缺货的情况，使得产品从原价1980日元涨到了高中生难以接受的高价，白色稀有限定款甚至卖到30万日元。为了获得电子宠物，一些男生开始偷钱劫道，女生甚至会去选择援助交际。社会层面开始逐渐向电子宠物施加不良风评的压力，认为万代的新产品不仅害了新一代的孩子，而且还用饥渴营销这种上不了台面的方式榨干孩子们和家长的钱包。
讽刺女生为电子宠物去援交的漫画
而同时，越来越多玩具生产商看到了火热的市场，开始山寨仿制电子宠物。由于电子宠物的技术含量很低，所以复制模仿起来非常快速，一时间，非万代生产的各种外形、各种宠物、各种类型的模仿品扑向市场。
其实万代并非故意压货，而是因为CPU产量跟不上，以及对良品率（当时不良率为7‰）的严格把关，导致满足不了市场的需求。当初错误的判断预期，使得1997年日本市场上的正版电子宠物数量被仿品全面压过，因为抬价和缺货等原因无法购买产品的用户开始选择各种仿制品。此时，无奈的万代选择将这些玩具生产商告上法庭，用法律维护自己刚刚开创的电子宠物事业。
然而“电子宠物侵权”一案胜诉后，万代和横井昭裕并未继续他们的维权行动。案件引用的不正当竞争法，主要是针对电子宠物的“扁平卵型外观”、“中央下部的三个按键”、“中部屏幕”等设计特色来甄别是否侵权。可市面上大部分产品为了合理规避侵权的可能，都在功能和外观上区别设计，甚至用其他游戏方式代替宠物养成。就连万代自己都有为动画《数码宝贝》推出电子宠物仿品“暴龙机”，更不论市面上的其他玩具商了。维权行动难以继续，万代只得把大笔资金投入到正品电子宠物的生产中。
结果，1998年电子宠物在风评压力、杂乱仿品和游戏性低的综合影响下快速退烧。万代后续生产的电子宠物销售不畅，现货大量积压在仓库中吃灰。直到1999年，万代被迫销毁了250万份库存，造成了60亿日元的损失，直接导致赤字45亿日元。
数码暴龙机
1998年电子宠物的退潮，让万代把市场重点转移到了海外。虽然电子宠物同样在其他国家受到热捧，但也很快褪去了“社会热点”的光环。而电子宠物极易仿制的特性，使它在海外遭遇的侵权更多更甚。2000年之后，万代甚至一度来到深圳，要求当地政府配合协助铲除制造仿品的工厂。可惜这些维权行动依旧阻止不了这些山寨货疯狂流入内地和亚洲其他地区，当年国内绝大部分购买电子宠物的学生，手中基本没有产自万代的正品。
经过万代统计，初代电子宠物的总销量高达4000万套，日本和海外各分摊2000万套，可是商业上的误判使得万代内部很难再推进这一项目。在各种间断提案和研讨后，直到2004年第二代电子宠物才面世。
逐渐定型的商业模式
进入2000年后，万代高层才真正冷醒地坐下来，讨论电子宠物该如何继续发展。在当时万代社长杉浦幸昌的带头下，2002年末终于决定推出第二代电子宠物。考虑到手机已经逐渐普及到了中学，新一代电子宠物把主攻市场转移到了小学中；为解决段子宠物短命的现实问题，需要对“宠物”进行品牌化处理。
后期黑白版的电子宠物增加了红外通讯功能
2003年中学生之间毫无预兆地又掀起了一次电子宠物的人气小高潮，促使万代在2004年正式推出了第二代电子宠物。这一代电子宠物不仅在硬件上进行了升级，还添加了红外发射和接受通信口，可以让不同玩家之间进行联机交换信息；养成过程被故事化、角色化处理，为游戏塑造了几个鲜明的宠物形象。依托这样的基础，万代以硬件设备为中心，连续多年开展动画、漫画、游戏、动画电影等诸多衍生项目，成功维持了产品的生命周期。黑白液晶版电子宠物的销售一直持续到了2008年，长达4年的销售期让这一代电子宠物的销量达到了3000万套，重新回到了大众视野中。
电子宠物的品牌形象
黑白机停产后，万代又加推新一代彩色液晶版电子宠物。在之后的近10年时间里，电子宠物的软硬件不断更新，越来越多的宠物、玩法和衍生产品像年货一般有序推上市场。虽然之后的产品没能重演黑白版初代的巅峰，横井昭裕的公司最终也被万代吞并，但不可否认，电子宠物作为一款异类掌机，它在行业中有着不可代替的历史地位，以及引领全球市场风潮的超高影响力。毕竟，这是款销量超过8000万台的游戏机。
