农村信用社和农村商业银行的区别主要在于，农村信用社是农村合作金融机构，而农商银行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。区别主要包括3个方面：
一、性质不同
农商银行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构
农村信用合作社是经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。
二、资本规模不同
全国各地都有自己的农村商业银行，由农村合作银行改制而来，不同的农商行其资本的构成要素也不一样。主要的服务对象是其所在地域的农村居民和农村经济发展。
农村信用合作社则是由农民入股组成，实行入股社员民主管理，主要为入股社员服务的合作金融组织，一般规模都相对较小，属于区域性的。
三、经营范围不同
农村商业银行提供各银行产品和服务，同时开展金融市场业务及资产管理业务并包括各种理财业务。
农村信用合作社其主要任务是筹集农村闲散资金，为农业、农民和农村经济发展提供金融服务。同时，组织和调节农村基金，支持农业生产和农村综合发展支持各种形式的合作经济和社员家庭经济，限制和打击高利贷。