刷脸支付的原理是人脸识别技术，人脸识别是生物识别的一种方式。
听上去高大上，用人话来表述就是：教机器认人——让机器来判断现在正在使用账号的人到底是不是账号的所有者，来进行身份验证。
技术原理：人脸特征模板识别
支付宝的人脸识别技术采用在该领域广泛应用的区域特征分析算法，它融合了计算机图像处理技术与生物统计学原理于一体，利用计算机图像处理技术从视频中提取人像特征点，利用生物统计学的原理进行分析建立数学模型，即人脸特征模板。利用已建成的人脸特征模板与被测者的人的面像进行特征分析，根据分析的结果来给出一个相似值。通过这个值即可确定是否为同一人。
说得更加技术宅一些，阿里巴巴提供的材料显示的技术原理是：这个系统人脸识别中各个环节全部基于深度神经网络技术（CNN），通过人脸检测、关键点定位、特征提取和特征比对等技术手段，从图像或视频中发现，定位人脸进而识别出人脸所属的人的身份。